廣東藥科大學附屬第二醫院(粵拼:gwong2 dung1 joek6 fo1 daai6 hok6 fu6 suk6 dai6 ji3 ji1 jyun2) 係中國廣東廣州嘅一間有醫療、教學、科研、康復、預防、保健喺埋一齊嘅二級甲等醫院。1981年12月起好,位置喺海珠區新港西路167號。
醫院喺1981年12月起好,初期係廣州海運集團屬下嘅一間醫院,嗌過廣州海員醫院個名。2002年12月改名做廣州新海醫院。2007年11月,由於廣東藥學院(今日嘅廣東藥科大學)正式加盟,醫院亦改名做廣東藥學院附屬第二醫院。2016年3月底又改次名做廣東藥科大學附屬第二醫院。